《柯南》主线剧情有如下：

1集、云霄飞车杀人事件

2集、董事长千金绑架事件

3集、偶像密室杀人事件

4集、大都会暗号地图事件

5集、新干线大爆破事件

6集、情人节杀人事件

7集、每月一件礼物恐吓事件

14集、奇怪的寻亲杀人事件

33集、咖啡厅杀人事件

43集、卡拉OK厅杀人事件

44集、江户川柯南诱拐事件

49-50集、外交官杀人事件

51集、图书馆杀人事件

53-54集、雾天狗传说杀人事件

56集、电玩公司杀人事件

59-60集、福尔摩斯迷杀人事件

78-79集、柯南VS怪盗基德

99-102集、走投无路的名侦探！连续两大杀人事件

124-125集、浪花连续杀人事件

135集、黑衣组织10亿元抢劫事件

136-139集、来自黑衣组织的女子集、大学教授杀人事件

140-141集、竞技场无差别胁迫事件

172-173集、飞天密室集、工藤新一最初的事件

181-182集、黑暗中的死角

190-192集、与黑衣组织的再会

203-208集、危命的复活

209-210集、意味深长的八音盒

235-238集、被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德

241-243集、人鱼失踪记

245-246集、格斗游戏的陷阱

249-250集、神秘的乘客

261集、元太的灾难

265-266集、陷入网中的谜团

272-273集、本厅刑事恋爱物语4

277-278集、来自芝加哥的男子

291-292集、犯罪的遗物

293-294集、急忙掩饰的忽略

299-300集、英语教师VS西部名侦探

301-302集、疯狂足球迷

306-307集、中华街集、雨中的似曾相识

308-310集、工藤新一纽约事件

311-312集、光彦森林迷失记

332-333集、遗留的无声证言

334-336集、与黑衣组织的接触

354-355集、金钱买不到的友情

360-361集、东都显影所的秘密

363-364集、四辆保时捷