维吾尔族古代信仰过萨满教、摩尼教、景教、祆教和佛教。
10世纪中叶喀喇汗朝萨图克·布格拉汗归信伊斯兰教后，喀什噶尔、叶尔羌、和阗地区改奉伊斯兰教。
13世纪初阿克苏、库车、焉耆地区维吾尔人改奉伊斯兰教。
14世纪时，天山北路伊犁、塔城等地区维吾尔人改奉伊斯兰教。
公元10世纪末至16世纪初，吐鲁番、哈密等东疆地区维吾尔人改奉伊斯兰教。
当前，维吾尔族多数信仰伊斯兰教，多属于逊尼派。

一日食三餐，早饭吃馕和各种瓜果酱、甜酱，喝奶茶、油茶等，午饭是各类主食，晚饭多是馕、茶或汤面等。以面食为主，喜食牛、羊肉。主食的种类有数十种。最常吃的有馕、羊肉抓饭、包子、面条等。 维吾尔族喜欢饮茯茶、奶茶。夏季多伴食瓜果。 新疆盛产绵羊，由此维吾尔族便有了烤羊肉串的习俗。讲究的羊肉串肉质鲜嫩，味咸辣，孜然的特殊味浓郁。 与羊肉串相媲美的手抓饭，也是维吾尔族的传统风味食品。在新疆维吾尔、乌孜别克等民族地区，逢年过年，婚丧娶嫁的日子里，都必备抓饭待客。他们的传统习惯是请客人围坐在桌子旁，上面铺上一块干净的餐巾。随后主人一手端盘，一手执壶，逐个让客人净手，并递给干净毛巾擦干。然后主人端来几盘抓饭，置餐巾上（习惯是二至三人一盘），请客人直接用手从盘中抓吃，故取名为“抓饭”。维吾尔族抓饭的种类很多，花色品种十分丰富。

维吾尔族待客和作客都有讲究。如果来客，要请客人坐在上席，摆上馕、各种糕点、冰糖等，夏天还要摆上一些瓜果，先给客人倒茶水或奶茶。待饭做好后再端上来，如果用抓饭待客，饭前要提一壶水，请客人洗手。吃完饭后，由长者领作“都瓦”，待主人收拾食具完，客人才能离席。吃饭时，客人不可随便拨弄盘中食物，不可随便到锅灶前去，一般不把食物剩在碗中，同时注意不让饭屑落地，如不慎落地，要拾起来放在自己跟前的“饭单”上。共盘吃抓饭时，不将已抓起的饭粒再放进盘中。

客人不能东张西望或立起。饭前饭后必须洗手，洗后只能用手帕或布擦干，忌讳顺手甩水，认为那样不礼貌。